Лабораторијата за испитување на води ги следи и оценува хигиенската исправност, и прави бактериолошка анализа на води од градски водовод, јавни и индивидуални и водоснабдителни објекти по барање на странки, базени, површински води, езера и друго.

За лабораторијата за испитување на вода од 2012 година имаме и акредитација од ИАРМ за методите, ИСО 9308-1, ИСО 7899-2. Во припрема се и останатите методи за контрола на водата, број на микроорганизми на 37 и 22 степени ИСО 6222, како и ИСО16266 за псеудомонас.